Ústav mikrobiologie

Zpráva o řešení projektu TAČR TREND

Ústav mikrobiologie LF UP a FNOL končí k 31. prosinci 2024 první rok řešení projektu TAČR TREND. Účastníky projektu jsou dále DIANA Biotechnologies a Ústav mikrobiologie 2. LF UK a FN Motol.

Hlavním cílem projektu je vyvinout sadu pro rychlou a vysoce citlivou diagnostiku nejčastějších původců sepse metodou multiplex PCR přímo z primárního vzorku krve bez nutnosti předchozí kultivace v hemokultuře. Bude vyvinut prototyp soupravy a provedeno funkční testování a validace v klinickém provozu tak, aby mohla být následně po skončení projektu dokončena certifikace produktu v rámci regulatoriky IVDR a souprava mohla být uvedena na trh klinické diagnostiky v ČR i zahraničí.

Vývojový projekt vyžaduje inovativní řešení v několika vývojových krocích. Splnění hlavního cíle projektu bude dosaženo za pomoci dvou průběžných výstupů: (1) vývoje metod pro zpracování a koncentraci krevního vzorku k zajištění dostatečné citlivosti malého množství DNA patogenu ve vzorku, (2) vývoje funkčních vzorků PCR metod pro jednotlivé patogeny a pro nejčastější geny antibiotické resistence.

Díky projektu má vzniknout žádaná alternativa k doposud převládající standardní diagnostice sepsí založené na kultivaci patogenů, která je však s ohledem na akutnost a závažnost stavu příliš zdlouhavá (typicky 8-24 hodin) a v některých případech nejednoznačná (negativní hemokultura sepsi nevylučuje). Rychlejší detekce původce sepsí za použití metody PCR umožní rychlejší a efektivnější léčbu, což přispěje jak k ochraně života pacienta, tak k efektivnějšímu užívání antibiotik a prevenci rozvoje bakteriální rezistence.