Ústav mikrobiologie

Sylaby

• MIK/VCA12 (.doc)
• MIK/VCB11 (.doc)

Zkoušky

• Otázky k praktické zkoušce z mikrobiologie (.doc)
• Otázky k teoretické zkoušce z mikrobiologie (.doc)

Prezentace

• Antimikrobní přípravky (.pdf)
• Antimikrobní profylaxe (.pdf)
• Problematika bakteriální rezistence (.ppt)
• Antibiotika v léčbě anaerobních infekcí (.ppt)
• Respirační infekce (.pdf)
• Literatura k ATB léčbě (.pdf)
• Nová antibiotika (.pdf)
• Sekvenční ATB léčba (.pdf)
• Antibiotická léčba v intenzivní medicíně (.pdf)
• Sepse z pohledu mikrobiologa (.pdf)

Sylaby

• MIK/ZUA12 (.doc)
• MIK/ZUB12 (.doc)

Zkoušky

• Otázky k teoretické zkoušce z mikrobiologie - Zubní lékařství (.pdf)

Prezentace

• Působení bakterií v dutině ústní (.pdf)
• Grampozitivní bakterie (.pdf)
• ATB profylaxe a terapie v zubním lékařství (.pdf)
• Antimikrobní přípravky (.pdf)
• Diferenciální mikrobiologická diagnostika krční lymfadenitidy (.pdf)
• Bakteriální rezistence (.ppt)
• Literatura k ATB léčbě (.pdf)
• Mycoplasma, Chlamydia, Chlamydophila (.pdf)
• Úvod do virologie (.pdf)
• Retroviry, AIDS (.pdf)

Sylaby

• Semináře z klinické mikrobiologie MIK/VC021 (.doc)
• Péče o pacienta v sepsi MIK/VC031 (.doc)
• Kazuistiky antibiotické léčby MIK/VC051 (.doc)
• Interpretace mikrobiologických vyšetřovacích postupů v klinické medicíně MIK/VC061 (.doc)
• Virologické kazuistiky MIK/VC071
• Vedení ATB léčby dle zásad Antibiotic Stewardship MIK/VC081
• Diagnostika COVID-19 a léčebné možnosti u COVID-pozitivních pacientů MIK/VC082

Prezentace

• Infekce močového traktu (.ppt)
• Intraabdominální infekce (.ppt)
• Virové pneumonie (.pdf)
• Nozokomiální pneumonie (.pdf)
• Sepse (.pdf)
• Sepse z pohledu mikrobiologa (.pdf)

Semináře z klinické mikrobiologie MIK/VC021

• Zásady racionální ATB terapie
• Horní cesty dýchací
• Dolní cesty dýchací
• Horečka+sepse
• Meningitidy
• Artritidy z pohledu mikrobiologa

Interpretace mikrobiologických vyšetřovacích postupů v klinické medicíně MIK/VC061

• Vybrané parazitární nákazy v ČR
• Přehled antiparazitik a strategie léčby nejvýznamnějších parazitárních infekcí

Veškere informace a studijní materiály jsou dostupné na Moodle.

• Microbiology II MIK/VAA12 (.doc)
• Microbiology I MIK/VAB11 (.doc)
• Clinical cases of ATB therapy MIK/VA051 (.doc)
• Clinical cases of viral infections MIK/VA071
• Management of ATB treatment according to the principles of Antibiotic Stewardship MIK/VA081
• Diagnosis of Covid-19, treatment options MIK/VA082
• Syllabus of questions for practical exam (.pdf)
• Syllabus of questions for teoretical exam (.pdf)
• Figures (.pdf)

• Characterization of prokaryotic cells (.pdf)
• Types of microorganisms (.pdf)
• Growth and reproduction of bacteria (.pdf)
• Chemical structures of microorganisms (.pdf)
• Shape, size and arrangement of microorganisms (.ppt)
• Pathogenesis of bacterial infection (.pdf)
• Spores (.pdf)
• Morphology I (.ppt) 
• Morphology II (.ppt)
• Commensal and pathogenic microbial flora (.pdf)
• ATB therapy (.pdf)
• Antibiotics I (.pdf)
• Antibiotics II (.pdf)
• Antibiotics III (.ppt)
• The Genus  Streptococcus (.pdf)
• The Genus Staphylococcus (.pdf)
• The Genus Clostridium (.pdf)
• The Genus Neisseria (.pdf)
• The Genus Vibrio  (.pdf)
• The Genus Mycobacterium (.pdf)
• The Genus Mycoplasma   (.pdf)
• Genera Chlamydia and Chlamydophila (.pdf)
• Virology (.pdf)
• Virology DNA viruses (.ppt)
• Virology RNA viruses (.ppt)
• Viral pneumonias (.pdf)

• Syllabus of questions (.pdf)
• Microbiology II MIK/ZAA12 (.doc)
• Microbiology I MIK/ZAB11 (.doc)

• Characterization of prokaryotic cells (.pdf)
• Types of microorganisms (.pdf)
• Chemical structures of microorganisms (.pdf)
• Growth and reproduction of bacteria (.pdf)
• Commensal and pathogenic microbial flora (.pdf)
• Pathogenesis of bacterial infection (.pdf)
• Spores (.pdf)
• Antibiotics I (.pdf)
• Antibiotics II (.pdf)
• Antibiotics III (.ppt)
• The Genus Clostridium (.pdf)
• The Genus  Streptococcus (.pdf)
• The Genus Staphylococcus (.pdf)
• The Genus Neisseria (.pdf)
• The Genus Mycobacterium (.pdf)
• Mycoplasma (.pdf)
• Chlamydia and Chlamydophila (.pdf)
• Virology (.pdf)
• DNA viruses (.pdf)
• RNA viruses (.pdf)

• Kolar M, Bardon J, Chroma M, Hricova K, Stosova T,  Sauer P, Koukalova D
  ESBL and AmpC beta-lactamase-producing Enterobacteriaceae in poultry in the Czech Republic 
  Veterinarni medicina, 2010; 55: 119-124

• Panáček A, Kolář M, Večerová R, Prucek R, Soukupová J, Kryštof V, Hamal P, Zbořil R, Kvítek L
  Antifungal activity of silver nanoparcticles against Candida spp.
  Biomaterials, 2009; 30:6333-6340

• Hradil P, Hlaváč J, Soural M, Hajdúch M, Kolář M, Večeřová R
  3-hydroxy-2-phenyl-4(1H)-quinolinones as promising biologically active compounds
  Min. Reviews in Med. Chemistry, 2009; 9:676-702

• Kolář M, Sauer P, Faber E, Kohoutová J, Štosová T, Sedláčková M, Chromá M, Koukalová D, Indrák K:
  Prevalence and spread of Pseudomonas aeruginosa and Klebsilla pneumoniae strains in patiens with haematological malignancies
  New Microbiologica, 2009; 32:  67-76

• Bardoň J, Kolář M, Čekanová L, Hejnar P, Koukalová D:
  Prevalence of Campylobacter jejuni and its resisstance to Antibiotics in Poultry in the Czech Republic
  Zoonoses and Public Health, 2009; 56: 111-116 

• Trtkova, Pavlicek, Ruskova, Hamal, Koukalova, Raclavsky
  Perfomance of optimized McRAPD in identification on 9 yeast species frequently isolated from patient samples: potential for automation
  BMC Micribiol, 2009; 9:1.11

• V Raclavský, V Husicková, Z Moránová, M Okhusu, O Fisher, J Precek, J Trtková, K Takeo, S Kawamoto
  Growth strategy of the pathogenic yeast Cryptococcus neoformans submerged culture under different cultivation formats.
  Folia Microbiol, 2009; 54:349-352 10

• Zuzana Moranova, Susumu Kawamoto, Vladislav Raclavsky
  Hypoxia sensing in Cryptococcus neoformans: biofilm-like adaptation for dormancy?
  Biomed Pap Med Fac Univ Palacky Olomouc Czech Repub, 2009; 153:3. 189-193 Sep

• V Raclavský, J Pavlíček, R Novotný, Z Moráňová, M Okhusu, J Trtková, K Takeo, S Kawamoto
  Peculiar clusters of daughter cells observed in Cryptococcus neoformans grown in sealed microtiter plates.
  Folia Microbiol 2009; 54:4.369-371 10

• Čekanová L, Kolář M:
  Rezistence komunitních kmenů Streptococcus agalactiae k makrolidovým antibiotikům
  Klinická farmakologie a farmacie, 2008; 22(2) 24-26

• Petr Hamal, Jiri Ostransky, Milos Dendis, Radek Horváth, Filip Ruzicka, Vladimir Buchta, Marcela Vejsova, Pavel Sauer, Petr Hejnar, Vladislav Raclavsky
  A case of endocarditis caused by the yeast Pichia fabianni with biofilm production and developed in vitro resistance to azoles in the course of antifungal treatment.
  Med Mycol, 2008; 46.6.601-605 Sep

• P Sauer, J Síla, T Stosová, R Vecerová, P Hejnar, I Vágnerová, M Kolár, V Raclavský, J Petrzelová, Y Lovecková, D Koukalová
  Prevalence of genes encoding extracellular virulence factors among methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolates from the University Hospital , Olomouc, Czech Republic.
  J Med Microbiol, 2008; 57:4.403-410 Apr 

• Chromá M, Kolář M, Sauer P, Marek O, Koukalová D:
  Molekulárno-biologická analýza ESBL-pozitívnych izolátov Klebsiella pneumoniae od pacientov v intenzívnej starostlivosti
  Kinická mikrobiologie a infekční lékařství, 2007; 13(5) 207-212

• Kolář M, Bardoň J, Vágnerová I, Saier P, Koukalová D, Petrželová J, Čekanová L, Pospíšil R:
  Resistance to Antibiotics Strains of Staphylococcus spp, Enterococcus spp and Escherichia coli Isolated from Rectal Swabs of Pigs
  Acta Veterinaria, 2007;

• Urbánek K, Kolář M, Lovečková Y, Strojil J, Šantavá L:
Influence of 3rd-generation cephalosporin utilizaiton on the occurrence of ESBL-positive Klebsiella pneumoniae strains
Journal of Clinical Pharmacy, 2007; 32: 403-407

• Jitka Trtkova, Vladislav Raclavsky
  Molecular-genetic approaches to identification and typing of pathogenic Candida yeast
  Biomed Pap Med Fac Univ Palacky Olomouc, Czech Repub, 2006; 1.51-61 Jul

• Radek Plachý, Petr Hamal, Vladislav Raclavský
  McRAPD as a new approach to rapid and accurate identification of pathogenic yeasts.
  Microbiol Methods, 2005; 60:1.107-113 Jan

• P Hamal, J Dostál, V Raclavský, M Krylová, I Pichova, O Hrusková-Heidlngsfeldová
  Secreted aspartate proteinases, a virulence factor of Candida spp : occurrence among clinical isolates
  Folia Microbiol, 2004; 49: 4.491-496

• Kolář M, Urbánek K, Látal T:
  Antibiotic selective pressure and development of bacterial resistance
  Internatonal Journal of Antimicrobial Agents, 2001; 357-363

• Kolář M, Vágnerová I, Urbánek K:
The impact of antibiotic selective pressure on vancomycin-resistant entrococci occurrence 
Biologia, 2001; 56(5):31-35

Ústav mikrobiologie podle prostorových kapacit a časových možností školitelů přijímá studenty do doktorského (Ph.D.) studia, vede diplomové i bakalářské práce studentů PřF UP a vypisuje témata SVOČ pro studenty LF UP. Zájemci se mohou průběžně informovat u jednotlivých výzkumných pracovníků, před podáním přihlášky je vždy nutné osobní seznámení a konzultace nad tématem.

Pro Ph.D. studium jsou témata vypisována centrálně, informace o přijímacím řízení lze pro aktuální rok najít na stránkách LF UP pod odkazem "Doktorský studijní program - Přijímací řízení". Vedení bakalářských a diplomových prací  je domlouváno individuálně. Témata SVOČ jsou vypisována centrálně, před termínem vypsání je možné po domluvě pracovat na zkoušku jako volontér. O organizaci SVOČ apod. více informací též na http://www.cja.upol.cz/svoc/.

Mykologická skupina / Research - mycology group

Mykologická skupina pracuje v návaznosti na rutinní mykologickou laboratoř ústavu. Pokud chcete výzkumnou skupinu nebo rutinní laboratoř kontaktovat elektronicky (doporučeno) a jste na pochybách, na kterou konkrétní osobu se obrátit, můžete využít obecnou adresu mykologie@upol.cz. Přehled kontaktů na jednotlivé členy skupiny najdete níže.

Skupina je tvořena dvěma "senior researchers" (MUDr. Vladislav Raclavský, Ph.D. a doc. MUDr. Petr Hamal, Ph.D.), 1 Ph.D. studentkou (MDDr. Lucie Svobodová), a 1 diplomantkou ( Bc. Ivana Horáková).

V centru zájmu skupiny jsou v současné době dva projekty, podrobnosti o odborné náplni těchto projektů lze získat kliknutím na jejich názvy níže.

1. Druhová identifikace patogenních kvasinek založená na analýze teploty tání produktů fingerprintingu (technika McRAPD).
2. Odpověď na hypoxii u patogenní kvasinky Cryptococcus neoformans (připravujeme).

Kontakty mykologická skupina/Contacts - mycology research group

Pro telefonické spojení vytočte/to call a person please dial:

    +420 58 563 a linku (viz níže)/and extension (see below)
    fax: +420 58 563 2417

Senior researchers:

    Petr Hamal, linka/extension 2403
    Vladislav Raclavský, linka/extension 9515
    Pro současné kontaktování obou můžete využít/To contact both use mykologie@upol.cz.

Studenti DSP/Ph.D. students:

    Lenka Rusková, linka/extension 9505

Laborantky/Technicians:

    Ivana Dosedělová, linka/extension 2405 

Další kontakty/Other useful extensions:

    Rutinní laboratoř/Routiny mycology lab, linka/extension 2405
    Výzkumná laboratoř/Research lab, linka/extension 2654