Ústav mikrobiologie
Aktuality
Všeobecné informace
Adresa
Ústav mikrobiologie Hněvotínská 3 775 15 Olomouc telefon: 585 632 402 fax: 585 632 417 | ![]() |
Personální složení
Přednosta:
prof. MUDr. Milan Kolář, Ph.D.
milan.kolar@fnol.cz
Pracovník odpovědný za organizaci výuky:
Bc. Petra Procházková, DiS.
petra.prochazkova@fnol.cz
Zástupce přednosty pro LP:
MUDr. Yvona Lovečková, Ph.D.
yvona.loveckova@fnol.cz
Sekretářka:
Eva Přikrylová
eva.prikrylova@upol.cz, eva.prikrylova@fnol.cz
telefon: 585 632 402
Ostatní členové
doc. MUDr. Dagmar Koukalová, CSc. dagmar.koukalova@fnol.cz
doc.MUDr. Petr Hamal, Ph.D. petr.hamal@fnol.cz
doc.MVDr. Jan Bardoň, MBA, Ph.D. jbardon@svuol.cz
MUDr.Iva Vágnerová, Ph.D. iva.vagnerova@fnol.cz
MUDr.Vladislav Raclavský, Ph.D. rac@tunw.upol.cz
Mgr. Pavel Sauer, Ph.D. pavel.sauer@fnol.cz
MUDr. Miroslava Htoutou Sedláková miroslawa@centrum.cz
Ing. Magdaléna Röderová, Ph.D. m.roderova@gmail.com
Mgr. Vendula Pudová, Ph.D. vendula.husickova@upol.cz
MUDr. Mgr. Kateřina Bogdanová, Ph.D. katerina.bogdanova@upol.cz
MDDr. Lucie Svobodová, Ph.D. lucie.svobodova@fnol.cz
Mgr. Renata Večeřová, Ph.D. renata.vecerova@fnol.cz
Mgr. Patrik Mlynárčik, Ph.D. patrik.mlynarcik@gmail.com
RNDr. Lucie Janovská, Ph.D. lucie.janovska@upol.cz
MUDr. Peter Odion Imwensi peter.imwensi01@upol.cz
Mgr. Taťána Štosová, Ph.D. tatana.stosova@fnol.cz
Mgr. Kristýna Hricová kristyna.hricova@upol.cz
Výuka
Všeobecné lékařství
Sylaby
Zkoušky
- Otázky k praktické zkoušce z mikrobiologie (.doc)
- Otázky k teoretické zkoušce z mikrobiologie (.doc)
Prezentace
- Antimikrobní přípravky (.pdf)
- Antimikrobní profylaxe (.pdf)
- Problematika bakteriální rezistence (.ppt)
- Antibiotika v léčbě anaerobních infekcí (.ppt)
- Respirační infekce (.pdf)
- Literatura k ATB léčbě (.pdf)
- Nová antibiotika (.pdf)
- Sekvenční ATB léčba (.pdf)
- Antibiotická léčba v intenzivní medicíně (.pdf)
- Sepse z pohledu mikrobiologa (.pdf)
Zubní lékařství
Sylaby
Zkoušky
Prezentace
- Působení bakterií v dutině ústní (.pdf)
- Grampozitivní bakterie (.pdf)
- ATB profylaxe a terapie v zubním lékařství (.pdf)
- Antimikrobní přípravky (.pdf)
- Diferenciální mikrobiologická diagnostika krční lymfadenitidy (.pdf)
- Bakteriální rezistence (.ppt)
- Literatura k ATB léčbě (.pdf)
- Mycoplasma, Chlamydia, Chlamydophila (.pdf)
- Úvod do virologie (.pdf)
- Retroviry, AIDS (.pdf)
Semináře
Sylaby
- Semináře z klinické mikrobiologie MIK/VC021 (.doc)
- Péče o pacienta v sepsi MIK/VC031 (.doc)
- Kazuistiky antibiotické léčby MIK/VC051 (.doc)
- Interpretace mikrobiologických vyšetřovacích postupů v klinické medicíně MIK/VC061 (.doc)
- Virologické kazuistiky MIK/VC071
- Vedení ATB léčby dle zásad Antibiotic Stewardship MIK/VC081
- Diagnostika COVID-19 a léčebné možnosti u COVID-pozitivních pacientů MIK/VC082
Prezentace
- Infekce močového traktu (.ppt)
- Intraabdominální infekce (.ppt)
- Virové pneumonie (.pdf)
- Nozokomiální pneumonie (.pdf)
- Sepse (.pdf)
- Sepse z pohledu mikrobiologa (.pdf)
Semináře z klinické mikrobiologie MIK/VC021
- Zásady racionální ATB terapie
- Horní cesty dýchací
- Dolní cesty dýchací
- Horečka+sepse
- Meningitidy
- Artritidy z pohledu mikrobiologa
Interpretace mikrobiologických vyšetřovacích postupů v klinické medicíně MIK/VC061
Zdravotnické obory
Veškere informace a studijní materiály jsou dostupné na Moodle.
Evaluace
English programme
General Medicine
- Microbiology II MIK/VAA12 (.doc)
- Microbiology I MIK/VAB11 (.doc)
- Clinical cases of ATB therapy MIK/VA051 (.doc)
- Clinical cases of viral infections MIK/VA071
- Management of ATB treatment according to the principles of Antibiotic Stewardship MIK/VA081
- Diagnosis of Covid-19, treatment options MIK/VA082
- Syllabus of questions for practical exam (.pdf)
- Syllabus of questions for teoretical exam (.pdf)
- Figures (.pdf)
- Characterization of prokaryotic cells (.pdf)
- Types of microorganisms (.pdf)
- Growth and reproduction of bacteria (.pdf)
- Chemical structures of microorganisms (.pdf)
- Shape, size and arrangement of microorganisms (.ppt)
- Pathogenesis of bacterial infection (.pdf)
- Spores (.pdf)
- Morphology I (.ppt)
- Morphology II (.ppt)
- Commensal and pathogenic microbial flora (.pdf)
- ATB therapy (.pdf)
- Antibiotics I (.pdf)
- Antibiotics II (.pdf)
- Antibiotics III (.ppt)
- The Genus Streptococcus (.pdf)
- The Genus Staphylococcus (.pdf)
- The Genus Clostridium (.pdf)
- The Genus Neisseria (.pdf)
- The Genus Vibrio (.pdf)
- The Genus Mycobacterium (.pdf)
- The Genus Mycoplasma (.pdf)
- Genera Chlamydia and Chlamydophila (.pdf)
- Virology (.pdf)
- Virology DNA viruses (.ppt)
- Virology RNA viruses (.ppt)
- Viral pneumonias (.pdf)
Dentistry
- Syllabus of questions (.pdf)
- Microbiology II MIK/ZAA12 (.doc)
- Microbiology I MIK/ZAB11 (.doc)
- Characterization of prokaryotic cells (.pdf)
- Types of microorganisms (.pdf)
- Chemical structures of microorganisms (.pdf)
- Growth and reproduction of bacteria (.pdf)
- Commensal and pathogenic microbial flora (.pdf)
- Pathogenesis of bacterial infection (.pdf)
- Spores (.pdf)
- Antibiotics I (.pdf)
- Antibiotics II (.pdf)
- Antibiotics III (.ppt)
- The Genus Clostridium (.pdf)
- The Genus Streptococcus (.pdf)
- The Genus Staphylococcus (.pdf)
- The Genus Neisseria (.pdf)
- The Genus Mycobacterium (.pdf)
- Mycoplasma (.pdf)
- Chlamydia and Chlamydophila (.pdf)
- Virology (.pdf)
- DNA viruses (.pdf)
- RNA viruses (.pdf)
Věda a výzkum
Publikace
- Kolar M, Bardon J, Chroma M, Hricova K, Stosova T, Sauer P, Koukalova D
ESBL and AmpC beta-lactamase-producing Enterobacteriaceae in poultry in the Czech Republic
Veterinarni medicina, 2010; 55: 119-124
- Panáček A, Kolář M, Večerová R, Prucek R, Soukupová J, Kryštof V, Hamal P, Zbořil R, Kvítek L
Antifungal activity of silver nanoparcticles against Candida spp.
Biomaterials, 2009; 30:6333-6340
- Hradil P, Hlaváč J, Soural M, Hajdúch M, Kolář M, Večeřová R
3-hydroxy-2-phenyl-4(1H)-quinolinones as promising biologically active compounds
Min. Reviews in Med. Chemistry, 2009; 9:676-702
- Kolář M, Sauer P, Faber E, Kohoutová J, Štosová T, Sedláčková M, Chromá M, Koukalová D, Indrák K:
Prevalence and spread of Pseudomonas aeruginosa and Klebsilla pneumoniae strains in patiens with haematological malignancies
New Microbiologica, 2009; 32: 67-76
- Bardoň J, Kolář M, Čekanová L, Hejnar P, Koukalová D:
Prevalence of Campylobacter jejuni and its resisstance to Antibiotics in Poultry in the Czech Republic
Zoonoses and Public Health, 2009; 56: 111-116
- Trtkova, Pavlicek, Ruskova, Hamal, Koukalova, Raclavsky
Perfomance of optimized McRAPD in identification on 9 yeast species frequently isolated from patient samples: potential for automation
BMC Micribiol, 2009; 9:1.11
- V Raclavský, V Husicková, Z Moránová, M Okhusu, O Fisher, J Precek, J Trtková, K Takeo, S Kawamoto
Growth strategy of the pathogenic yeast Cryptococcus neoformans submerged culture under different cultivation formats.
Folia Microbiol, 2009; 54:349-352 10
- Zuzana Moranova, Susumu Kawamoto, Vladislav Raclavsky
Hypoxia sensing in Cryptococcus neoformans: biofilm-like adaptation for dormancy?
Biomed Pap Med Fac Univ Palacky Olomouc Czech Repub, 2009; 153:3. 189-193 Sep
- V Raclavský, J Pavlíček, R Novotný, Z Moráňová, M Okhusu, J Trtková, K Takeo, S Kawamoto
Peculiar clusters of daughter cells observed in Cryptococcus neoformans grown in sealed microtiter plates.
Folia Microbiol 2009; 54:4.369-371 10
- Čekanová L, Kolář M:
Rezistence komunitních kmenů Streptococcus agalactiae k makrolidovým antibiotikům
Klinická farmakologie a farmacie, 2008; 22(2) 24-26
- Petr Hamal, Jiri Ostransky, Milos Dendis, Radek Horváth, Filip Ruzicka, Vladimir Buchta, Marcela Vejsova, Pavel Sauer, Petr Hejnar, Vladislav Raclavsky
A case of endocarditis caused by the yeast Pichia fabianni with biofilm production and developed in vitro resistance to azoles in the course of antifungal treatment.
Med Mycol, 2008; 46.6.601-605 Sep
- P Sauer, J Síla, T Stosová, R Vecerová, P Hejnar, I Vágnerová, M Kolár, V Raclavský, J Petrzelová, Y Lovecková, D Koukalová
Prevalence of genes encoding extracellular virulence factors among methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolates from the University Hospital , Olomouc, Czech Republic.
J Med Microbiol, 2008; 57:4.403-410 Apr
- Chromá M, Kolář M, Sauer P, Marek O, Koukalová D:
Molekulárno-biologická analýza ESBL-pozitívnych izolátov Klebsiella pneumoniae od pacientov v intenzívnej starostlivosti
Kinická mikrobiologie a infekční lékařství, 2007; 13(5) 207-212
- Kolář M, Bardoň J, Vágnerová I, Saier P, Koukalová D, Petrželová J, Čekanová L, Pospíšil R:
Resistance to Antibiotics Strains of Staphylococcus spp, Enterococcus spp and Escherichia coli Isolated from Rectal Swabs of Pigs
Acta Veterinaria, 2007;
- Urbánek K, Kolář M, Lovečková Y, Strojil J, Šantavá L: Influence of 3rd-generation cephalosporin utilizaiton on the occurrence of ESBL-positive Klebsiella pneumoniae strains
Journal of Clinical Pharmacy, 2007; 32: 403-407
- Jitka Trtkova, Vladislav Raclavsky
Molecular-genetic approaches to identification and typing of pathogenic Candida yeast
Biomed Pap Med Fac Univ Palacky Olomouc, Czech Repub, 2006; 1.51-61 Jul
- Radek Plachý, Petr Hamal, Vladislav Raclavský
McRAPD as a new approach to rapid and accurate identification of pathogenic yeasts.
Microbiol Methods, 2005; 60:1.107-113 Jan
- P Hamal, J Dostál, V Raclavský, M Krylová, I Pichova, O Hrusková-Heidlngsfeldová
Secreted aspartate proteinases, a virulence factor of Candida spp : occurrence among clinical isolates
Folia Microbiol, 2004; 49: 4.491-496
- Kolář M, Urbánek K, Látal T:
Antibiotic selective pressure and development of bacterial resistance
Internatonal Journal of Antimicrobial Agents, 2001; 357-363
- Kolář M, Vágnerová I, Urbánek K: The impact of antibiotic selective pressure on vancomycin-resistant entrococci occurrence
Biologia, 2001; 56(5):31-35
Doktorský studijní program
Ústav mikrobiologie podle prostorových kapacit a časových možností školitelů přijímá studenty do doktorského (Ph.D.) studia, vede diplomové i bakalářské práce studentů PřF UP a vypisuje témata SVOČ pro studenty LF UP. Zájemci se mohou průběžně informovat u jednotlivých výzkumných pracovníků, před podáním přihlášky je vždy nutné osobní seznámení a konzultace nad tématem.
Pro Ph.D. studium jsou témata vypisována centrálně, informace o přijímacím řízení lze pro aktuální rok najít na stránkách LF UP pod odkazem "Doktorský studijní program - Přijímací řízení". Vedení bakalářských a diplomových prací je domlouváno individuálně. Témata SVOČ jsou vypisována centrálně, před termínem vypsání je možné po domluvě pracovat na zkoušku jako volontér. O organizaci SVOČ apod. více informací též na http://www.cja.upol.cz/svoc/.
Mykologie
Mykologická skupina / Research - mycology group
Mykologická skupina pracuje v návaznosti na rutinní mykologickou laboratoř ústavu. Pokud chcete výzkumnou skupinu nebo rutinní laboratoř kontaktovat elektronicky (doporučeno) a jste na pochybách, na kterou konkrétní osobu se obrátit, můžete využít obecnou adresu mykologie@upol.cz. Přehled kontaktů na jednotlivé členy skupiny najdete níže.
Skupina je tvořena dvěma "senior researchers" (MUDr. Vladislav Raclavský, Ph.D. a doc. MUDr. Petr Hamal, Ph.D.), 1 Ph.D. studentkou (MDDr. Lucie Svobodová), a 1 diplomantkou ( Bc. Ivana Horáková).
V centru zájmu skupiny jsou v současné době dva projekty, podrobnosti o odborné náplni těchto projektů lze získat kliknutím na jejich názvy níže.
- Druhová identifikace patogenních kvasinek založená na analýze teploty tání produktů fingerprintingu (technika McRAPD).
- Odpověď na hypoxii u patogenní kvasinky Cryptococcus neoformans (připravujeme).
Kontakty mykologická skupina/Contacts - mycology research group
Pro telefonické spojení vytočte/to call a person please dial:
+420 58 563 a linku (viz níže)/and extension (see below)
fax: +420 58 563 2417
Senior researchers:
Petr Hamal, linka/extension 2403
Vladislav Raclavský, linka/extension 9515
Pro současné kontaktování obou můžete využít/To contact both use mykologie@upol.cz.
Studenti DSP/Ph.D. students:
Lenka Rusková, linka/extension 9505
Laborantky/Technicians:
Ivana Dosedělová, linka/extension 2405
Další kontakty/Other useful extensions:
Rutinní laboratoř/Routiny mycology lab, linka/extension 2405
Výzkumná laboratoř/Research lab, linka/extension 2654
Odkazy
- Fakultní nemocnice Olomouc
- www.atb-centra.cz
- Společnost pro lékařskou mikrobiologii
- Moravsko-slovenské mikrobiologické dny
- Státní veterinární ústav Olomouc
- The European Antimicrobial Resistance Surveillance System
- European Society of Clinical Microbioogy and Infectious Diseases
- ICAAC Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy
- ISHAM International Society for Human and Animal Mycology
- BIOMEDREG